冷凍離心機的工作原理主要分兩部分，即離心部分和冷凍部分。主要包括驅動電機、驅動電路、顯示器、壓縮機組、鋼制機架、電子門鎖、合金轉子體等部件構成。通過程序的設置能實現離心轉數可調，離心時間可設定，離心溫度可控制三個基本的要素。冷凍離心機可分為超高或高速冷凍離心機和低速冷凍離心機，其應用的領域和實驗范圍又有區別。

　　冷凍離心機需要冷凍控溫系統主要是取決于兩個原因：

　　一是依據離心機高轉速運行時轉子體與空氣摩擦生熱導致機身溫度不易控制，過高溫度影響離心機內部元件的使用壽命。這也就是冷凍離心機和普通離心機的區別，冷凍離心機帶有制冷系統，能夠控制溫度保護機器元件，普通離心機不帶制冷系統。

　　二是根據用戶實驗要求，必須配有低溫控制系統，比如分離一些有機活性物質：酶，有機易揮發的物質等需要恒溫或是溫差不超過正負10℃。來保證實驗條件滿足實驗設計需要，確保實驗順利進行。

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